馬感染牛乳頭瘤病毒(BPV)1型和2型會(huì)引發(fā)最常見的皮膚腫瘤病,稱為馬肉瘤。這種腫瘤具有頑固性和復(fù)發(fā)性,與BPV 1/2型誘發(fā)的牛皮膚乳頭瘤的退行性形成鮮明對(duì)比。馬特異性BPV 1/2型變種在馬群中的傳播,被認(rèn)為可解釋馬與牛感染BPV 1/2型在臨床表現(xiàn)方面的差異。為驗(yàn)證這種假設(shè),我們使用納米孔測(cè)序法,確定了98個(gè)完整的BPV 1/2型基因組。我們使用單獨(dú)的BPV1/2型基因序列比對(duì),推斷出貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育樹。通過使用貝葉斯標(biāo)簽關(guān)聯(lián)顯著性軟件(BaTS),我們對(duì)宿主進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育與形狀關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了共179個(gè)特異性BPV-1和128個(gè)BPV-2型基因替換。病毒基因組的E2編碼區(qū)表現(xiàn)出異常高的非同義突變率(81%,n = 13/16)。有趣的是,我們從馬源樣本中的L1/L2編輯區(qū)發(fā)現(xiàn)了大批量缺失(高達(dá)1.5 kb)。然而,馬和牛宿主均表現(xiàn)出最常檢出的單核苷酸多態(tài)性,這符合BaTS結(jié)果,表明系統(tǒng)發(fā)育與宿主之間沒有關(guān)聯(lián)性。我們發(fā)現(xiàn)馬源BPV-1/2亞型中可能存在馬特異性突變,但這些突變并未導(dǎo)致馬適應(yīng)型遺傳變異。根據(jù)這些研究結(jié)果可推斷出,從牛到馬的跨物種傳播似乎是一個(gè)持續(xù)的過程,而不是一種古老的病毒傳播,這導(dǎo)致馬適應(yīng)型BPV變種在馬群中的傳播。
原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37336425/